基因融合是肿瘤中一类重要的分子变异，其在癌症中的发生率约为20%。其中ALK、ROS1、RET、NTRK融合以及METex14跳跃突变，是非小细胞肺癌中十分关键的可用药靶点，多款对应的靶向药物已经成为临床标准治疗选择。临床中经常遇到这样的困境：部分患者做完DNA-NGS检测报告全阴性，但临床高度怀疑存在融合变异，后续补充RNA检测后，才检出可用药靶点，抓住靶向治疗机会。

但真实临床现状更加严峻：绝大多数病例不会继续补测RNA。临床工作节奏快、样本有限、检测流程繁琐，更多患者直接被默认判定为“驱动基因阴性”，从而进入化疗、免疫治疗，彻底错失靶向治疗机会。

PART1

DNA-NGS检测融合与METex14跳跃，天生存在哪些短板？

DNA-NGS非常擅长检出点突变、插入缺失、基因拷贝数扩增，但面对基因融合、METex14跳跃这类变异，存在天然缺陷。

• 对于穿刺来源的FFPE石蜡包埋标本，肿瘤面积常小于3 mm²，肿瘤细胞占比有限，经过福尔马林固定石蜡包埋之后，会发生核酸交联，虽然DNA可较好保留，但RNA极易发生片段化、降解，进一步放大分子检测的难度。

• 绝大多数融合断点落在内含子区域，ROS1、NTRK等基因部分内含子长度可达数百kb，容易造成探针覆盖不足；同时内含子富含各类重复序列，DNA捕获或扩增难以完整覆盖，容易漏掉部分罕见融合变异。断点区重复序列（如ALK基因的LINE元件）还会干扰测序reads比对，提升生物信息学分析的判读难度。

• METex14跳跃突变变异形式高度异质：可诱发跳突的剪接相关变异分散分布于13、14号内含子，DNA检测难以实现全部覆盖；部分DNA检出的变异临床意义不明，无法直接证实是否真实发生剪接跳跃。而RNA-NGS可直接检测转录本，直观观察外显子14缺失情况，确认变异是否具备功能活性。

• 部分DNA重排不产生功能性转录本（假阳性率15%～20%）；RNA-NGS直接检测mRNA转录本，可以验证融合是否真实表达，区分有无临床意义的变异。

PART2

国内外指南&专家共识：DR共检的权威推荐

随着临床证据积累，DNA+RNA同步共检已经从科研走向规范化临床实践，国内、国际权威指南均对-DNA-NGS-的局限性、RNA-NGS的价值给出明确建议。

1. 《中华医学会肺癌临床诊疗指南(2025版)》明确提出：临床实践中，利用基于DNA的检测技术对标本进行一次性NGS检测较为普遍，而基于RNA的检测技术对融合基因检出可能更具优势。考虑到肺癌患者肿瘤组织获取有限、治疗的及时性以及检测的经济性，建议有条件的医疗机构可对NSCLC的甲醛固定、石蜡包埋标本进行一次同步基于RNA与DNA的驱动基因变异（融合/突变）检测。

2. 《实体瘤常见驱动基因DNA和RNA高通量测序共检专家共识(2025版）》国内首部专门针对DR共检的病理共识，系统阐述DNA-NGS与RNA-NGS各自优劣势，明确了DNA/RNA-NGS共检可以数据互补，提高变异的检出率和准确性。共识分析了3种DNA/RNA-NGS共检方式的各自优缺点，并推荐根据肿瘤类型、组织样本量、检测时限，并结合临床需求等其他因素，选择最合适的DNA/RNA-NGS检测策略，从而最大程度满足肿瘤精准诊治的需求。

3. 《基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识》强烈推荐：相比DNA-based NGS，RNA-based NGS不受内含子影响，可提升融合基因的检出率。建议有条件的医疗机构对NSCLC样本进行一次性同步RNA-based NGS与DNA-based NGS的驱动基因变异（融合/突变）检测。

4. NCCN非小细胞指南(2026.V6)推荐：基于RNA的NGS可提高ALK、ROS1、RET、NTRK融合以及METex14跳跃的检出能力。并指出对于NRG1基因融合等变异，无法通过基于DNA的NGS检测到，原因是NRG1中的长内含子通常未包含在靶向基于DNA的NGS组合或全外显子测序中。

5. ESMO NGS临床实践指南(2024版)指出：目前融合基因NGS检测可基于DNA和RNA水平进行测序，虽然DNA比RNA更稳定，但相比DNA水平，RNA水平上融合基因表现为前后两个基因外显子之间的衔接，融合点相对固定，因此在RNA水平上检测融合基因比DNA水平更易实现，也更加准确。

6. ASCO临床检测建议提出：仅依靠DNA大panel 检测，有可能遗漏部分功能性基因融合；当DNA测序未检出明确驱动变异时，应考虑补充融合检测挖掘潜在可用药靶点。针对FFPE降解样本，同步DNA+RNA检测有助于弥补单纯DNA检测的技术短板，提升融合及METex14跳突的检出可能性。

PART3

DR共检的核心临床价值总结

• 契合国内外指南共识的推荐，提升分子检测的完整度。

• 充分利用有限肿瘤标本：一份样本同步完成DNA与RNA检测，避免序贯检测造成样本耗竭，减少重复活检。

• 减少靶点漏检：弥补单纯DNA-NGS在内含子区融合、METex14跳跃突变上的技术局限，提升可用药融合及剪接变异的检出率。

• 区分功能性变异：通过RNA转录本验证融合是否真实表达，甄别DNA检出的无临床意义重排，提高检测结果可靠性。

• 加快诊疗效率：单次检测即可同时获得点突变、拷贝数、融合、METex14跳跃等全套分子信息，助力临床快速制定治疗方案。

精准检测，是靶向治疗的第一道关口。越来越多临床证据提示，单纯DNA-NGS无法覆盖全部可用药靶点，尤其穿刺小活检、长期存放的FFPE蜡块等特殊样本类型，也是融合、METex14跳跃漏检的高发场景。

DNA+RNA一体化共检，不是简单DNA加上RNA检测，而是在有限样本条件下，兼顾突变、拷贝数、基因融合、剪接变异的高效方案，与国内、国际指南共识的推荐方向高度契合。

厦门飞朔生物持续深耕实体瘤伴随诊断，充分关注FFPE小活检临床痛点，围绕非小细胞肺癌等各类实体肿瘤及血液肿瘤领域，持续打磨DNA+RNA共检相关技术能力，致力于帮助临床尽可能挖掘更多可用药靶点，为患者靶向治疗方案选择提供更完善的分子依据。

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